Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29094F6Q785 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29094F6Q785 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms