Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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