Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo5cE9Q1F5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms