Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc175E9PVB3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms