Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms