Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rtl10D3YWW5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms