Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nlrc5C3VPR6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms