Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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