Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms