Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed5B2RPU8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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