Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spocd1B1ASB6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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