Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms