Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1aA2APX8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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