Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramel3A2AHA7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms