Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms