Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3238W4VSP7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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