Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Speer3W4VSP1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms