Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdpk1Q9Z2A0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms