Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn8Q9Z260 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn8Q9Z260 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms