Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uso1Q9Z1Z0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uso1Q9Z1Z0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms