Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T6

Pikfyve, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PikfyveQ9Z1T6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PikfyveQ9Z1T6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PikfyveQ9Z1T6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PikfyveQ9Z1T6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms