Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema4fQ9Z123 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4fQ9Z123 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4fQ9Z123 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms