Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn1Q9Z0I7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slfn1Q9Z0I7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms