Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL4

Grk1, Rhodopsin kinase, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grk1Q9WVL4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grk1Q9WVL4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grk1Q9WVL4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grk1Q9WVL4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms