Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnip1Q9WUU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnip1Q9WUU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms