Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcsQ9WU84 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcsQ9WU84 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms