Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn5Q9WU28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn5Q9WU28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms