Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam50bQ9WTJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fam50bQ9WTJ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50bQ9WTJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms