Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma1Q9R1P4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms