Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma4Q9R1P0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma4Q9R1P0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms