Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trex2Q9R1A9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms