Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lamc3Q9R0B6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Lamc3Q9R0B6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Lamc3Q9R0B6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Lamc3Q9R0B6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms