Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab1Q9R078 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms