Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BcamQ9R069 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BcamQ9R069 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcamQ9R069 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcamQ9R069 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcamQ9R069 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcamQ9R069 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcamQ9R069 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcamQ9R069 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcamQ9R069 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcamQ9R069 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms