Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsjQ9R014 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms