Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsfQ9R013 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtsfQ9R013 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms