Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Npas3Q9QZQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms