Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms