Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Phtf1Q9QZ09 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf1Q9QZ09 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf1Q9QZ09 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf1Q9QZ09 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf1Q9QZ09 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf1Q9QZ09 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf1Q9QZ09 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf1Q9QZ09 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf1Q9QZ09 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms