Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tomm40Q9QYA2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm40Q9QYA2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms