Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms