Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e3Q9QXZ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms