Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip4Q9QXN3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip4Q9QXN3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms