Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacl1Q9QXE0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacl1Q9QXE0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms