Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr5Q9JLF7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr5Q9JLF7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms