Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms