Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms