Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem3Q9JKE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms