Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Alyref2Q9JJW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Alyref2Q9JJW6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Alyref2Q9JJW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alyref2Q9JJW6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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