Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gfra4Q9JJT2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms